A investigação científica é um dos eixos fundamentais da missão do CIS que visa a aplicação imediata do conhecimento produzido para a identificação e solução dos problemas que existem na sociedade.
O CIS concebeu as normas inerentes a investigação obedecendo os deveres legais, e visa estimular actividades no sentido de responder ou resolver problemas concretos nas áreas de ciências sociais, humanas, economia e saúde para o desenvolvimento sustentável da sociedade. Desta forma, as políticas de investigação do CIS procuram o alinhamento com os Planos de Desenvolvimento Nacional (2023-2027) e a Estratégia de Longo Prazo (ELP) Angola 2050, que definem as directrizes, estratégias e metas para dar continuidade às propostas de graduação, pós-graduação e investigação científica. Na mesma vertente, alinha-se ao documento da Estratégia Nacional de Ciência, Tecnologia e Inovação (ENCTI), que se define como um conjunto de acções, metas e programas que visam a materialização a curto e médio prazo dos objectivos estabelecidos na Política Nacional de Ciência, Tecnologia e Inovação, na perspectiva de situar Angola na vanguarda do conhecimento científico e tecnológico.